Problema:

Submit de una pagina en APEX con javascript pasando a la vez variables/valores en el request.

Solución:

Usar el carácter de escape " en substitución de " :

javascript:apex.submit({request:"SAVE",set:{"P400_REPORT_ID":2}});

Passing as argument an APEX variable:

javascript:apex.submit(
{request:"SAVE"
,set{"P400_REPORT_ID":"&P400_MPP_REPORT_ALL_Y_ID."}});